相沢は事件直後から第一師団軍法会議予審に付され、岡田予審官が二ヶ月間にわたり厳重取調べた。相沢事件の第一師団軍法会議の予審は１１．２０日に終結する。島田朋三郎検察官の手許で起訴状が作成された。第一師団軍法会議長官・柳川平助中将の決裁を経、同中将はこれを川島陸相に報告をなし、相沢中佐は陸軍刑法の「用兵器上官暴行罪」ならびに一般刑法の「殺人罪」および「傷害罪」をもって正式起訴された。

　１９３６（昭和１１）．１．２８日、第1師団軍法会議による公開裁判が行われた。これが第１回公判となる。裁判長（判士長）は陸軍少将第一旅団長の佐藤正三郎。判士３名(大佐２名、中佐１名)、法務官１名の計５名が裁判官として任命された。法務官は相沢公判のため特に先般第十師団より新井朋重が選ばれ着任した。検察官は法務官の島田朋三郎、弁護人は弁護士、法学博士の鵜沢聡明、特別弁護人、陸軍歩兵中佐の満井佐吉であった。公判は、問題が教育総監更迭に関し、勅裁を受けている大正2年の省部規定を蹂躙した軍首脳部の行動が統帥権干犯となるや否やに絞られ、林陸相の行動が統帥権干犯となるか、林陸相にあえてそれを行わせた永田軍務局長に陰謀の事実があったかどうかが事件の焦点となった。

　第一回公判につき、次のように評されている。

「第一回公判は、翌年1月28日から行われた。2・26事件の直接のきっかけは、この裁判であったと考えられる。まるで皇道派が舞台をしつらえたかのような法廷で展開された思想戦の模様は青年将校の燃え滾る心に油を注いだ」。

　磯部浅一は「行動記」の中で次のように記している。

「相沢中佐のようにえらい事は余にはとても出来なかった。それで相沢事件以来は弱い自分の性根に反省を加え、これを叱咤激励する事につとめた。特にともすれば成功主義すなわち打算主義に流れようとする薄弱賎劣な心を打破して、一徹な正義観念によって何事もせねばならぬことを自己の信仰とせねばならぬと考えて一切の打算から離隔する事に努めた」。

「12月になってからは、1日から20日迄は他出して雑多な人と雑談する事をさけ、妄念の断離につとめた。これがため、毎朝早く起き明治神宮に参拝することと、北氏著の国体論の精読浄書を日課とした。かくの如くしている間に、余の腹中に何物か堅い決意の中心ができた。いよいよ決行出来るだけの腹が出来たというわけだ」

　２．１２日、第６回公判。陸軍次官の橋本虎之助中将を証人喚問する。２．１７日、第*回公判。陸軍大臣の林銑十郎大将を証人喚問する。２．２５日、第*回公判。前教育総監の真崎甚三郎大将を証人喚問する。軍機保持上公開を禁止した。三証人とも、職務として関与したものであるから勅許をまたずしては証言できないと肝心の点については証言を拒否した。鵜沢、満井両弁護人は勅許を仰いで真崎大将を再喚問するよう申請するとともに、斎藤実内府、池田成彬、木戸幸一、井上三郎、唐沢俊樹警保局長、下園佐吉（牧野前内府秘書）、太田亥十二を証人喚問することを申請した。軍法会議は勅許奏請の手続きを執らなければならない段階となり、軍中央部も反対することはできなくなった。ところが2月26日払暁に二・二六事件が勃発したことにより一時中断された。

　この時期、即ち、2・26事件の直前の軍の大勢は、皇道派で占められ、相沢公判のような事件についてさえも、同情をもつ者が多かった。西田税らは次のように主張している。

「国体明徴、粛軍、維新革命は三位一体で、相沢中佐蹶決の真因もここにある。したがって超法規的な国体、超法律的維新に殉ずるもの、そのうくるところも、また同じく超法律的でなければならない」。