１９１０（明治４３）．７月、バイロンの紹介やプラトン全集の翻訳などで知られていた哲学者で翻訳家の木村鷹太郎（１８７０ー１９３１年）が、「読売新聞」紙上に「東西両大学及び修史局の考証を駁す──倭女王卑弥呼地理に就いて」を発表した。同氏は、「邪馬台国＝エジプト説」を唱え、内藤教授の「卑弥呼考」による邪馬台国＝畿内説、白鳥教授の「倭女王卑弥呼考」による邪馬台国＝北九州説の両説に真っ向から噛みついた。ここに三つ巴論争の原形が定まった。（「邪馬台国はエジプトにあった!?─木村鷹太郎の邪馬台国＝エジプト説─」参照）

　木村鷹太郎のエジプト説は奇異な感じがするが、九州、近畿の両説の欠陥を激しく揶揄するところにおいては鋭いものがあり、今日の水準においてもなお精彩を放っているといえる。こうしてみれば、邪馬台国論争とは、当初より九州説と畿内説とその他異説との三つ巴の論争として捉えることが史学的であり、九州説と畿内説との二大論争かの如くに流布することは正確とはいい難く、問題ありと云えるであろう。

　木村は、九州説、畿内説のご都合主義的「原文読み替え」に異議を唱え、次のように批判した。

　その上で次のように推定した。

　こうして、魏志倭人伝は、地中海から東アジアに及ぶ広大な地域を支配していた時代の日本を記録したものであり、この記録を携えて西方から移民してきた中国人が、東洋で編纂された歴史書の中に、この記録を混入させたのが魏志倭人伝だと所論した。こうして次のように比定した（「木村説に基づく航路図」）　（以上の行程を地図にしてみたので、参照されたい。）。

　なお、女王卑弥呼は神功皇后と同一人物であり、その橿日（かしひ）宮はギリシア北西岸のエピルスのカシオペアである。皇后の「征伐」した新羅とは、エトラスカン人（エトルリア人のこと）の国で、その首都はローマであった。日本書紀に出てくる新羅三王の名は、ローマのタークイヌス王家（タルクイニウス。ローマ王国（紀元前７～６世紀）の王家でエトルリア人。もちろん時代が合わない）の中の３王である。また、卑弥呼の後継者、壱与（いよ）はエジプトの伝説上の女王イオ Io である（イオはギリシア神話に出てくるニンフで、エジプトの女神イシスと同一視される）。

　木村は、かって日本人は「太古欧亜の中央部に居を占め」、「伊太利（新羅）、希臘（筑紫）、亜拉比亜（伊勢）、波斯、印度、暹羅等は吾版図たり」とも主張した。彼にとって、日本人とは、古代エジプト人にして古代ギリシア人にして、しかも古代ローマ人であり、かってアフリカ、ヨーロッパから東アジアに至る版図を支配していた優秀な民族であった。古事記や日本書紀の語る世界は全て全世界に拡大され、そこに登場する神々はことごとくギリシア神話の神々や聖書の登場人物と結びつけられた。彼の頭の中では時空の観念が崩壊していたのである。彼は自らの妄想的歴史学を「新史学」と称し、自説を認めようとしない「旧史学」者たちを罵倒した。その壮絶な「新史学」の詳しい内容については、別稿「疑似歴史学事典／木村鷹太郎の「新史学」、木村鷹太郎の世界　──『海洋渡来日本史』を読む」参照のこと。