母体となったのは、内閣国土総合開発本部（総理府国土総合開発対策室を含む）、経済企画庁（総合開発局）、首都圏整備委員会事務局、近畿圏整備本部、中部圏開発整備本部、建設省（計画局宅地部の一部）、自治省の一部など。郵政省飯倉分館東側2階から4階までに入居。1983年（昭和58年）10月に、中央合同庁舎第5号館の23階から26階までに移転。2001年（平成13年）1月6日、中央省庁再編の実施に伴い運輸省、建設省、北海道開発庁と統合して、国土交通省が発足。防災行政は内閣府に移管。
歴代の国土庁長官等は次の通り。
| 代 | 氏名 | 内閣 | 在任期間 | 兼務等 |
|---|---|---|---|---|
| 国土庁長官（総理府） | ||||
| 1 | 西村英一 | 第2次田中角榮内閣 | 1974年6月26日 - 1974年11月11日 | |
| 2 | 丹羽兵助 | 第2次田中角榮内閣 | 1974年11月11日 - 1974年12月9日 | |
| 3 | 金丸信 | 三木内閣 | 1974年12月9日 - 1976年9月15日 | |
| 4 | 天野光晴 | 三木内閣 | 1976年9月15日 - 1976年12月24日 | |
| 5 | 田沢吉郎 | 福田赳夫内閣 | 1976年12月24日 - 1977年11月28日 | |
| 6 | 櫻内義雄 | 福田赳夫内閣 | 1977年11月28日 - 1978年12月7日 | 建設大臣 |
| 7 | 中野四郎 | 第1次大平内閣 | 1978年12月7日 - 1979年11月9日 | |
| 8 | 園田清充 | 第2次大平内閣 | 1979年11月9日 - 1980年7月17日 | |
| 9 | 原健三郎 | 鈴木善幸内閣 | 1980年7月17日 - 1981年11月30日 | 北海道開発庁長官 |
| 10 | 松野幸泰 | 鈴木善幸内閣 | 1981年11月30日 - 1982年11月27日 | 北海道開発庁長官 |
| 11 | 加藤六月 | 第1次中曽根内閣 | 1982年11月27日 - 1983年12月27日 | 北海道開発庁長官 |
| 12 | 稲村佐近四郎 | 第2次中曽根内閣 | 1983年12月27日 - 1984年11月1日 | 北海道開発庁長官 |
| 13 | 河本嘉久蔵 | 第2次中曽根内閣 | 1984年11月1日 - 1985年12月28日 | 北海道開発庁長官 |
| 14 | 山崎平八郎 | 第2次中曽根内閣 | 1985年12月28日 - 1986年7月22日 | |
| 15 | 綿貫民輔 | 第3次中曽根内閣 | 1986年7月22日 - 1987年11月6日 | 北海道開発庁長官・沖縄開発庁長官 |
| 16 | 奥野誠亮 | 竹下内閣 | 1987年11月6日 - 1988年5月13日 | |
| 17 | 内海英男 | 竹下内閣 | 1988年5月13日 - 1989年6月3日 | |
| 18 | 野中英二 | 宇野内閣 | 1989年6月3日 - 1989年8月10日 | |
| 19 | 石井一 | 第1次海部内閣 | 1989年8月10日 - 1990年2月28日 | |
| 20 | 佐藤守良 | 第2次海部内閣 | 1990年2月28日 - 1990年12月29日 | |
| 21 | 西田司 | 第2次海部内閣 | 1990年12月29日 - 1991年11月5日 | |
| 22 | 東家嘉幸 | 宮澤内閣 | 1991年11月5日 - 1992年12月12日 | |
| 23 | 井上孝 | 宮澤内閣 | 1992年12月12日 - 1993年8月9日 | |
| 24 | 上原康助 | 細川内閣 | 1993年8月9日 - 1994年4月28日 | 北海道開発庁長官・沖縄開発庁長官 |
| - | 羽田孜 | 羽田内閣 | 1994年4月28日 | 内閣総理大臣による事務取扱 |
| 25 | 左藤恵 | 羽田内閣 | 1994年4月28日 - 1994年6月30日 | |
| 26 | 小澤潔 | 村山内閣 | 1994年6月30日 - 1995年8月8日 | 北海道開発庁長官・沖縄開発庁長官（1995年1月20日以降） |
| 27 | 池端清一 | 村山内閣 | 1995年8月8日 - 1996年1月11日 | |
| 28 | 鈴木和美 | 第1次橋本内閣 | 1996年1月11日 - 1996年11月7日 | |
| 29 | 伊藤公介 | 第2次橋本内閣 | 1996年11月7日 - 1997年9月11日 | |
| 30 | 亀井久興 | 第2次橋本内閣 | 1997年9月11日 - 1998年7月30日 | |
| 31 | 柳澤伯夫 | 小渕内閣 | 1998年7月30日 - 1998年10月23日 | |
| 32 | 井上吉夫 | 小渕内閣 | 1998年10月23日 - 1999年1月14日 | 北海道開発庁長官・沖縄開発庁長官 |
| 33 | 関谷勝嗣 | 小渕内閣 | 1999年1月14日 - 1999年10月5日 | 建設大臣 |
| 34 | 中山正暉 | 小渕内閣 | 1999年10月5日 - 2000年4月5日 | 建設大臣 |
| 35 | 第1次森内閣 | 2000年4月5日 - 2000年7月4日 | 建設大臣 | |
| 36 | 林寛子（扇千景） | 第2次森内閣 | 2000年7月4日 - 2001年1月5日 | 建設大臣 運輸大臣・北海道開発庁長官（2000年12月5日以降） |
国土事務次官
| 氏名 | 在任期間 | 前職 | 退任後の役職 |
|---|---|---|---|
| 橋口收 | 1974.6.26 - 1976.6.11 | 大蔵省主計局長 | 国土庁顧問、公正取引委員会委員長、広島銀行頭取、会長 |
| 中橋敬次郎 | 1976.6.11 - 1977.11.19 | 国税庁長官 | 地域振興整備公団総裁 |
| 下河辺淳 | 1977.11.19 - 1979.7.20 | 計画・調整局長 | 国土庁顧問、総合研究開発機構理事長、東京海上研究所理事長 |
| 河野正三 | 1979.7.20 - 1981.6.10 | 長官官房長 | 住宅金融公庫総裁 |
| 山岡一男 | 1981.6.10 - 1982.6.1 | 土地局長 | |
| 福島量一 | 1982.6.1 - 1983.7.1 | 長官官房長 | 地域振興整備公団総裁、日本銀行監事 |
| 宮繁護 | 1983.7.1 - 1984.7.1 | 長官官房長 | 日本道路公団総裁 |
| 石川周 | 1984.7.1 - 1985.7.30 | 長官官房長 | |
| 永田良雄 | 1985.7.30 - 1986.6.10 | 長官官房長 | 参議院議員 |
| 吉居時哉 | 1986.6.10 - 1988.6.28 | 長官官房長 | |
| 清水達雄 | 1988.6.28 - 1989.9.1 | 長官官房長 | 参議院議員 |
| 的場順三 | 1989.9.1 - 1990.9.13 | 内閣官房内閣内政審議室長 | 大和総研理事長、内閣官房副長官 |
| 北村廣太郎 | 1990.9.13 - 1991.6.14 | 長官官房長 | 地域振興整備公団副総裁、阪神高速道路公団理事長 |
| 公文宏 | 1991.6.14 - 1992.6.23 | 内閣官房内閣内政審議室長 | 石油公団副総裁 |
| 藤原良一 | 1992.6.23 - 1993.7.2 | 長官官房長 | 本州四国連絡橋公団総裁 |
| 市川一朗 | 1993.7.2 - 1994.7.1 | 建設大臣官房総務審議官 | 参議院議員 |
| 藤原和人 | 1994.7.1 - 1995.6.22 | 長官官房長 | 農林漁業金融公庫副総裁、十八銀行頭取 |
| 三井康壽 | 1995.6.22 - 1996.7.2 | 長官官房長 | 住宅金融支援機構副理事長 |
| 竹内克伸 | 1996.7.2 - 1997.7.8 | 長官官房長 | 商工組合中央金庫副理事長、証券保管振替機構社長 |
| 近藤茂夫 | 1997.7.8 - 1999.7.13 | 長官官房長 | 内閣広報官、駐フィンランド大使 |
| 久保田勇夫 | 1999.7.13 - 2000.6.30 | 長官官房長 | 都市基盤整備公団副総裁、西日本シティ銀行頭取 |
| 木下博夫 | 2000.6.30 - 2001.1.5 | 長官官房長 | 国土交通省顧問、阪神高速道路社長 |
(私論．私見)