盤上での活躍の一方、盤外では酒、ギャンブル、借金、女性関係など破天荒な生活でも有名な「最後の無頼派」であった。癌の手術以前はアルコール依存症の禁断症状と戦いながらの対局を重ねていた。高利貸しから億単位の借金がありその大半を好きな競輪につぎ込んだ。政財界に藤沢のファンがおり、そのうちの一人である元法務大臣の稲葉修が「せめて借金先は銀行へ」と替えさせ借金の保証人になったという。１９７６年に創設された棋聖戦（第1期の優勝賞金は1700万円、現在は4500万円）を六連覇し借金を返済した。数々のタイトル賞金は、借金返済に充てただけでなく、なじみの芸者に銀座で店を持たせるためにぽんと出してやるなど、あっという間に消えていった。妻や家族のもとに賞金がやってきたことはなかったという。

　アルコール依存症であり七番勝負のときだけは禁断症状に苦しみながら酒を抜いた。本妻（藤沢モト）との間に３子がいたほか、２人の女性との間にそれぞれ２子をもうけており、子は全部で７人いる。正月になると４人の女性と子供たち全員が一斉に会し正月のあいさつを藤沢と本妻に対して行った。将棋棋士の米長邦雄は「俺とえらい違いだ。恐れ入った」と頭を下げたという。この勝負師を陰で支えた妻・モトは著書『勝負師の妻—囲碁棋士・藤沢秀行との五十年』で彼を襲った数々の難局について述べている。

　棋士育成

　若手育成に熱心で、門下に天野雅文、高尾紳路、森田道博、三村智保、倉橋正行、金沢真らがいる。他にも合宿などで依田紀基、結城聡、坂井秀至らを育てている。中国・韓国棋士も含め藤沢を師と仰ぐ者は多い。研究会/秀行塾は来るものは誰でも拒まずに受け入れ、若手棋士を育てた。門下生以外にも多くの若手棋士の育成に力を注いだ。昭和３０年代には、阿佐ヶ谷の自宅で、茅野直彦、当時十代であった林海峰、大竹英雄、工藤紀夫、高木祥一、小島高穂ら十数人による月２回の研究会を行なった。これにさらに若い世代の安倍吉輝、福井正明、酒井猛、石田章、中村秀仁らが加わる。

　１９６９年、不動産業のために代々木に事務所を開いたが、ここでも若手棋士が集まっての研究会が行われ、林海峰、曺薫鉉、四谷にあった木谷道場の石田芳夫、加藤正夫、武宮正樹、趙治勲らが集まり、事務所を閉じる１９７８年まで続いた。

　１９８０年からは、入段したばかりの依田紀基、安田泰敏、院生の藤沢一就、小松英樹らで第三次研究会を始め、場所もよみうりランドの自宅に移した。この研究会はその後も弟子の森田、三村、高尾の他にも人数が増え、１９８４年からは年に２回の合宿を行うようになる。このメンバーは秀行軍団などとも呼ばれる。

　１９８１年からは研究会のメンバーとともに訪中し、中国の棋士との手合や指導を行うようになる。これには聶衛平、劉小光、江鋳久、曹大元、若手の馬暁春、張文東らが参加した。病気との戦いも型破りだった。

　１９８３年に胃がんが発見された後、悪性リンパ腫で放射線治療、前立腺がんの投薬治療を行い３回がんを克服している。

　１９８７年まで毎年と、それ以後の断続的な訪中は、中国の実力レベル向上に大きく寄与した。「命がけで得た技術をなぜ他国に教える必要があるのか」という声もあるなか、中韓両国の若手棋士に惜しげもなく技術を伝授した。

　１９９９年に行われた引退三番碁では、第１局(4.16日)で常昊、第２局(4.30日)で曺薫鉉、第３局(5.14日)で高尾紳路と、日中韓の棋士が対戦相手を務めた。引退碁が行われたのは本因坊秀哉以来。死後の２０１０．６月には北京市に「藤沢秀行記念室」が設立された。

　家族・親族

　父の藤沢重五郎は相場師として名を挙げた人物で、賭博にも熱中したが囲碁でも三段の免状を持っていたとされる。田村保寿（のちの本因坊秀哉）と「鬼池田」と呼ばれた素人名人との対戦を企画した。何人もの女性相手に合計１９人の子供をつくった。囲碁の他にも、剣道三段、将棋五段、柔道三段（起倒流柔術）。甥に藤沢朋斎九段（姉の子。藤沢朋斎の叔父にあたる）、経済学者の松井彰彦がいる。妻の藤沢モトには、藤沢と暮らした人生を描いた著書が『勝負師の妻―囲碁棋士・藤沢秀行との五十年 』、『大丈夫、死ぬまで生きる 碁打ち　藤沢秀行‐‐無頼の最期』の二冊ある。三男の藤沢嘉浩はアマチュア囲碁強豪。五男の藤沢一就八段は新宿で囲碁教室を開催しており、２０１９年現在２０名前後の院生を抱え、過去に７人の棋士を輩出している。一就の長女であり、秀行の孫にあたる藤沢里菜は、２０１０年４月に当時史上最年少となる１１歳６か月で棋士となっており、女流棋士史上最年少タイトル獲得（１５歳９か月で第１回会津中央病院杯を獲得）などの実績がある。